RaTG13的墨江矿工传染途径假说MMP存在的致命错误

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关联组

经过分析判断RaTG13蝙蝠冠状病毒是伪造的

条件组

RaTG13的组成蛋白与基因组全序列

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本词条是基于闫博士报告的再编辑

墨江矿工传染途径(MMP)假说存在致命性缺陷

最近出现了一种理论,该理论提出SARS-CoV-2源自在2012年被感染的墨江矿工的肺部病毒传染[1]。具体地说,作者认为RaBtCoV/4991病毒确实是RaTG13,并且是引起2012年矿工患上肺炎的原因。在矿工的肺部中,RaTG13模拟了病毒的传代过程、发生了大规模的进化,并最终演变为SARS-CoV-2。在此过程中,病毒的受体结合域经历了强烈的正向选择,从而变得能很好地结合人类ACE2受体。此外,在刺突细胞的S1和S2连接区的Furin酶切位点,是经过病毒刺突蛋白基因与编码人ENaC蛋白的基因之间的重组而获得,后者的基因具有与SARS-CoV-2非常相似的Furin酶切位点的序列。此次传代的最终产物是SARS-CoV-2,研究人员从矿工的样本中分离出该病毒,并将其带回了武汉病毒研究所。作者已将此假设命名为墨江矿工传染途径假说(MMP)[2]


然而,墨江矿工传染途径假说存在致命的缺陷。


首先,无法界定或确认导致矿工患病的病毒病原体。

根据在主治医生撰写的硕士学位论文中的充分记录,两名患者(咽拭子和血液)的样本于2012年5月15日至5月20日之间在成都军区疾病预防与控制中心进行了检测,但并未发现包括SARS在内的所有可疑病毒[3]。此外,对冠状病毒引起的肺炎的临床诊断来说,其黄金标准是活检和/或尸检,然后通过逆转录聚合酶连锁反应或病毒分离进行确认。然而,所尝试的三次活检均以失败告终[4]。进行尸检的请求却遭死者家属拒绝[5]。由于这种失败,这篇硕士论文和后来也研究了同样问题的博士学位论文(尽管以间接方式),都将肺炎的原因描述为尚未解决的案例[6][7]


其次,矿工的抗体检测结果不支持SARS或SARS类冠状病毒感染。

根据硕士论文显示,对两名矿工的样本进行了SARS抗体检测[8]。一名矿工(病例3,去世)的症状发作日期是2012年4月13日左右。另一名矿工(病例4,有严重症状但康复了)的症状发作日期是2012年4月16日左右。根据钟南山博士后来的建议,于2012年6月19日在武汉病毒研究所进行了抗体检测。但是,检测的两个样本仅对IgM抗体呈阳性[9],没有报告阳性IgG或总抗体[10],也没有报告抗体滴度。重要的是,如果严重的肺炎是由冠状病毒感染引起的,那么在2012年6月19日进行抗体测试时,应同时检测出IgM和IgG 或总抗体。事实上,IgG或总抗体应该更丰富并且更容易被检测到[11]。另一方面,IgM的检测经常导致假阳性结果[12]。因此,仅检测到IgM抗体而非IgG或总抗体呈阳性的这一事实表明,(硕士和博士论文中)所描述的结果很可能是假阳性的,并且该感染不应是SARS或SARS类冠状病毒所引起的。


值得注意的是,后来的博士论文[13]与硕士论文对于同一临床检测的描述也显现出重大差异:

1. 博士论文描述了将四名矿工(咽拭子和血液)的样本送至成都军区疾病预防与控制中心进行核酸检测。然而,硕士论文指出,样本仅来自两名矿工[14]

2. 博士论文描述了来自四名矿工的样本在武汉病毒研究所进行的抗SARS的抗体检测,结果均为IgG呈阳性。然而,硕士论文指出,只有两个矿工的样本在武汉病毒研究所进行了检测,而且均为IgM呈阳性[15]


重要的是,硕士论文是由六名住院矿工的主治医生于2013年在云南撰写的[16]。然而,博士论文是于2016年在北京仅根据临床记录而撰写的。博士论文的作者没有直接参与矿工的治疗或所描述的任何检测[17]。因此,博士论文的作者极有可能没有验证他提供的临床数据,造成该博士学位论文为关于墨江矿工事件提供了不可靠的信息。



第三,即便SARS-CoV-2在2012年已经存在于矿工体内,那么这肯定会引发疫情甚至大流行。

鉴于SARS-CoV-2具有极高的传播能力,如果没有适当的个人防护装备进行保护,医生、护士、矿工的家属等不可能避免感染该病毒。如果在2012年确实发生了疫情,考虑到病毒的高传播性和致死性(即使为他们提供了精心的医疗服务,在六名肺炎患者中有三人死亡),这种疫情也不可能会被忽视。


第四,如1.1到1.5节所示,RaTG13的序列很明显是伪造的,该病毒在自然界中不存在。

RaTG13的发表过程中的疑点

RaTG13违背自然规律的遗传证据

RaTG13的RBD无法结合蝙蝠的ACE2


在2013年被检测到的RaBtCoV/4991病毒并不是由其报告的基因组序列所定义的RaTG13病毒。由于样本质量差,尚未有任何关于RaBtCoV/4991完整基因组序列的报道,这种情况经常发生,因为RNA的基因组很容易降解。RaBtCoV/4991病毒与SARS-CoV-2之间极有可能没有很高的同源性。该判断基于以下事实:尽管在过去的二十年中对冠状病毒进行了广泛的监视性研究,但在2020年之前报告的病毒都没有与SARS-CoV-2有超过90%的序列同一性。因此,即使RaBtCoV/4991是导致矿工患上肺炎的病原体,该病毒在一个人的肺部演变成SARS-CoV-2的理论也远远超出了合理的范围。


第五,病毒的刺突蛋白不可能通过与编码宿主细胞ENaC蛋白的基因重组,从而无法在S1和S2的连接区获得独特的Furin酶切位点(ENaC携带的Furin酶切位点与SARS-CoV-2的类似)。

这是因为重组需要两个参与基因之间的序列相似性达到显著水平,而在冠状病毒刺突蛋白和人类ENaC之间却不存在这种相似性。重组的分子基础不存在。(尽管不可能在ENaC和冠状病毒的刺突蛋白之间进行重组,但可疑的是病毒蛋白和宿主蛋白的Furin酶切位点具有相同的序列。不过,在 ENaC蛋白中的Furin酶切位点的序列[18]自1997年以来就已为人所知[19],它可用于设计SARS-CoV-2刺突蛋白的Furin酶切位点。由于ENaC和ACE2在多种不同类型的细胞里有共表达[20],因此这被认为是一种精密而复杂的设计。)


第六,如果SARS-CoV-2实际上是从矿工肺部中的RaBtCoV/4991进化而来的,那么在各个方面,它看起来都会像是自然形成的病毒。

在那种情况下,没有必要为RaTG13和其他新型冠状病毒(第2部分和第3部分)伪造序列,以捏造SARS-CoV-2的自然起源。


最后

正如我们先前的报告[21]所揭示的,SARS-CoV-2基因组中存在的证据表明,基因操纵是SARS-CoV-2历史的一部分。

  1. Latham, J. & Wilson, A. A Proposed Origin for SARS-CoV-2 and the COVID-19 Pandemic. Independent Science News, https://www.independentsciencenews.org/commentaries/a-proposed-origin-for-sars-cov-2-and-the-covid-19-pandemic/ (2020).
  2. Latham, J. & Wilson, A. A Proposed Origin for SARS-CoV-2 and the COVID-19 Pandemic. Independent Science News, https://www.independentsciencenews.org/commentaries/a-proposed-origin-for-sars-cov-2-and-the-covid-19-pandemic/ (2020).
  3. Li, X. The Analysis of Six Patients With Severe Pneumonia Caused By Unknown Viruses. Master’s Thesis, https://www.documentcloud.org/documents/6981198-Analysis-of-Six-Patients-With-Unknown-Viruses.html (2013).
  4. Li, X. The Analysis of Six Patients With Severe Pneumonia Caused By Unknown Viruses. Master’s Thesis, https://www.documentcloud.org/documents/6981198-Analysis-of-Six-Patients-With-Unknown-Viruses.html (2013).
  5. Li, X. The Analysis of Six Patients With Severe Pneumonia Caused By Unknown Viruses. Master’s Thesis, https://www.documentcloud.org/documents/6981198-Analysis-of-Six-Patients-With-Unknown-Viruses.html (2013).
  6. Li, X. The Analysis of Six Patients With Severe Pneumonia Caused By Unknown Viruses. Master’s Thesis, https://www.documentcloud.org/documents/6981198-Analysis-of-Six-Patients-With-Unknown-Viruses.html (2013).
  7. Huang, C. Novel Virus Discovery in Bat and the Exploration of Receptor of Bat Coronavirus HKU9. PhD Dissertation (in Chinese), National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention (2016).
  8. Li, X. The Analysis of Six Patients With Severe Pneumonia Caused By Unknown Viruses. Master’s Thesis, https://www.documentcloud.org/documents/6981198-Analysis-of-Six-Patients-With-Unknown-Viruses.html (2013).
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  14. Li, X. The Analysis of Six Patients With Severe Pneumonia Caused By Unknown Viruses. Master’s Thesis, https://www.documentcloud.org/documents/6981198-Analysis-of-Six-Patients-With-Unknown-Viruses.html (2013).
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  17. Huang, C. Novel Virus Discovery in Bat and the Exploration of Receptor of Bat Coronavirus HKU9. PhD Dissertation (in Chinese), National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention (2016).
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