与SARS-CoV-2相关的穿山甲冠状病毒的RBD与人ACE2结合的能力比穿山甲强

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经过分析判断,一系列提示穿山甲是SARS-CoV-2中间宿主的冠状病毒均为伪造

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本词条是基于闫博士报告的再编辑

已报道的穿山甲冠状病毒的RBD与穿山甲ACE2的结合较弱

如果穿山甲冠状病毒确实存在并且最近已经扩散到感染人类,那么它们的刺突蛋白,尤其是刺突中的RBD,应该更有效地结合到穿山甲的ACE2(pACE2)上,而非hACE2。


但是,最近的发现与这一理论相矛盾。在计算机演算中,Piplani等人,根据同源结构模型计算得出,SARS-CoV-2 刺突与来自人类或各种动物的ACE2之间的缔合所涉及的结合能量[1]。有趣的是,显示SARS-CoV-2 刺突产生的最有利的相互作用是与hACE2,而不是与穿山甲或任何其他可疑中间宿主的ACE2相互作用。此外,另一项研究表明,使用强大的体外结合测定法,SARS-CoV-2的RBD与hACE2的结合比与pACE2[2]的结合更紧密(大于9倍)。尽管穿山甲冠状病毒的RBD与SARS-CoV-2的RBD并非100%相同,但是这两种病毒的RBM是负责与ACE2相互作用的最基本的部分,仅相差一个氨基酸[3][4][5][6]。因此,在SARS-CoV-2的RBD和pACE2之间观察到的较弱的结合效率表明,报告中所说的穿山甲冠状病毒的RBD一定相当低效地结合到pACE2。确实,最近的一项研究证实了这种情况:穿山甲冠状病毒的RBD与pACE2的结合比与hACE2[7]的结合弱十倍。


这些发现再次驳斥了穿山甲是SARS-CoV-2可能的中间宿主的说法。更重要的是,后两项研究强烈表明这些病毒可能无法在穿山甲中确立感染,这大大增加了人们怀疑,即穿山甲冠状病毒的公开序列可能是伪造的,并且这些病毒在自然界中不存在。

  1. Piplani, S., Singh, P.K., Winkler, D.A. & Petrovsky, N. In silico comparison of spike protein-ACE2 binding affinities across species; significance for the possible origin of the SARS-CoV-2 virus. arXiv,arXiv:2005.06199 (2020).
  2. Mou, H. et al. Mutations from bat ACE2 orthologs markedly enhance ACE2-Fc neutralization of SARSCoV-2. bioRxiv, https://doi.org/10.1101/2020.06.29.178459 (2020).
  3. Lam, T.T. et al. Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature (2020).
  4. Liu, P. et al. Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)? PLoS Pathog 16, e1008421 (2020).
  5. Xiao, K. et al. Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins. Nature (2020).
  6. Zhang, T., Wu, Q. & Zhang, Z. Probable Pangolin Origin of SARS-CoV-2 Associated with the COVID-19 Outbreak. Curr Biol 30, 1578 (2020).
  7. Wrobel, A.G. et al. Structure and binding properties of Pangolin-CoV Spike glycoprotein inform the evolution of SARS-CoV-2. Research Square, DOI: 10.21203/rs.3.rs-83072/v1 (2020).